WWW.DISS.SELUK.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА
(Авторефераты, диссертации, методички, учебные программы, монографии)

 

Белорусский государственный университет

УТВЕРЖДАЮ

Декан биологического факультета

В.В. Лысак

«» 2011 г.

Регистрационный № УД-/р.

Практикум по специализации Учебная программа (рабочий вариант) для специальности:

1-31 01 01 Биология направления 1-31 01 01-03 Биотехнология (генетика) Факультет биологический (название факультета) Кафедра генетики (название кафедры) Курс (курсы) 3- Семестр (семестры) 6- Лекции Экзамен (количество часов) (семестр) Практические (семинарские) занятия Зачет 6, 7, (количество часов) (семестр) Лабораторные занятия 230 Курсовой проект (работа) (количество часов) (семестр) Всего аудиторных часов по дисциплине (количество часов) Всего часов Форма получения по дисциплине 230 высшего образования дневная (количество часов) Составили Лагодич А.В., к.б.н.; Глушен С.В., к.б.н., доцент; Анохина В.С.

доцент, к.б.н., Храмцова Е.А. к.б.н., доцент; Гринев В.В. к.б.н., доцент.

(И.О., Фамилия, степень, звание) 2011 г.

Учебная программа составлена на основе учебной программы «Практикум по специализации» 16.12.2008 г. регистрационный номер № УД-1926/уч. (название типовой учебной программы (учебной программы (см. разделы 5-7 Порядка)), дата утверждения, регистрационный номер) Рассмотрена и рекомендована к утверждению на заседании кафедры генетики (название кафедры) 20.05.2011 г., протокол № (дата, номер протокола) Заведующий кафедрой Н.П. Максимова (подпись) (И.О.Фамилия) Одобрена и рекомендована к утверждению Ученым советом биологического факультета 26.05.2011 г., протокол № (дата, номер протокола) Председатель В.Д. Поликсенова (подпись) (И.О.Фамилия)

ПОЯСНИТЕЛЬНАЯ ЗАПИСКА

Специальный практикум по биотехнологии посвящен изучению и освоению современных биоинформационных технологий, а также биотехнологических и молекулярно-генетических методов, знание которых необходимо в экспериментальной работе каждому специалисту-биотехнологу. Практикум включает 5 разделов – «Молекулярная генетика» «Введение в технику полимеразной цепной реакции», «Клонирование ДНК», «Микрогаметофитный отбор у растений (гаметная селекция)» и «Цитометрия».

Молекулярная генетика один из разделов генетики, изучающий молекулярные механизмы генетических процессов. Целью данного раздела спецпрактикума является освоение основных принципов и методов работы, необходимых для проведения молекулярно-генетических исследований (в частности, правил работы с лабораторным оборудованием и компьютерным обеспечением, методов работы с ДНК, возможностей метода полимеразной цепной реакции и секвенирования). Особое внимание будет обращено на освоение компьютерных программ (в частности, пакет программ DnaStar, VectorNTI, ImageQuante) и умение пользоваться информацией генетических банков данных (в частности, BLAST), необходимых для обработки полученных в ходе экспериментальной работы результатов.

Цитометрия представляет собой метод, основанный на компьютерных технологиях получения и обработки цифровых изображений клеток и субклеточных структур. Этот подход, получающий в современной клеточной биологии все большее распространение, призван повысить эффективность научных и прикладных исследований путем создания новых возможностей анализа информации о структурно-функциональных особенностях клеток в норме, эксперименте и при патологии.

Гаметная селекция растений основана на использовании гаметофитного отбора предложенного и теоретически обоснованного D. Mulcahy (1979). Автор высказал мысль, что отбор гаметофитов по устойчивости к экстремальным факторам может обеспечить появление в будущем спорофитов со сходной устойчивостью. Гаметная селекция имеет ряд преимуществ: 1) исследователь оперирует непосредственно с пыльцой и число генотипов, подвергаемых отбору, исчисляется миллионами; 2) малый размер пыльцы позволяет выполнять отбор в лабораторных условиях, без особых затруднений регулируя при этом условия среды (например, при помощи термостатов, фитотронов или теплиц); 3) гаплоидный генотип гаметофита позволяет выявлять при отборе редкие рецессивные аллели, выявлять сбалансированность генома; 4) гаплоиды более уязвимы для действия факторов среды, что позволяет проводить более корректно дифференцировку генотипов и их отбор на устойчивость к биотическим и абиотическим стрессам. Цель данного раздела специального практикума – освоить методы микрогаметофитного отбора для поиска (дифференцировки) перспективных по устойчивости к стрессам генотипов растений на примере работы с конкретным видом.

Клонирование ДНК один из основных способов генетического конструирование in vitro, основанный на введении индивидуальных фрагментов ДНК в клетку с получение рекомбинантных генетических структур с заданными свойствами. Целью этого раздела специального практикума является ознакомление студентов с различными молекулярными способами генетического конструирование in vitro.

Полимеразная цепная реакция – один из наиболее распространенных и востребованных методов молекулярной биологии, который широко используется как в фундаментальных, так и в прикладных областях науки. Учитывая большую значимость технологии полимеразной цепной реакции как метода молекулярно-биологических и медицинских исследований, а также, принимая во внимание ее широкое практическое применение, целью раздела «Полимеразная цепная реакция» специального практикума по генетике является выработка у студентов практических навыков проведения молекулярнобиологических исследований с использованием полимеразной цепной реакции.

В результате изучения дисциплины обучаемый должен:

закономерности наследования признаков при моно-, ди- и полигибридных скрещиваниях;

биологические основы размножения растений и животных;

клеточные, хромосомные, генные и молекулярные механизмы наследственности;

механизмы изменчивости генетического материала; закономерности онтогенеза;

основы генетики человека и его наследственных заболеваний;

генетические основы селекции;

вопросы экологической и популяционной генетики;

задачи и возможности клеточной и генетической инженерии;

принципы создания трансгенных растений и животных;

основные подходы генотерапии;

проводить и анализировать генетический эксперимент;

связывать данные генетики с достижениями цитологии, биологических основ размножения растений и животных, онтогенеза, эволюционной теории и селекции, а также с успехами в области биохимии нуклеиновых кислот, молекулярной биологии, микробиологии, вирусологии и иммунологии;

использовать достижения генетики в решении задач селекции, медицины, экологии и биотехнологии, а также применять полученные знания в дальнейшей практической деятельности.

Учебный курс рассчитан на 230 аудиторных часа, из них 230 - лабораторные занятия.

Выполнение лабораторных работ по каждому разделу предполагает проведение небольшого самостоятельного исследования с оформлением его результатов в виде отчета.

РАЗДЕЛ I. МОЛЕКУЛЯРНАЯ ГЕНЕТИКА

Этапы проведения молекулярно-генетических исследований. Правила приготовления растворов. Приготовление растворов нужной концентрации (молярность, процентность). Правила работы с лабораторным оборудованием (центрифуги, качалки, электрофорезные аппараты, прибор для анализа гелей, спектрофотометр, прибор для ПЦР, секвенатор). Освоение режимов настройки оборудования (прибор для анализа гелей, прибор для ПЦРанализа). Знакомство с компьютерным обеспечением. Принцип работы с компьютерными программами DnaStar, VectorNTI, ImageQuante. Возможности информационных ресурсов сайтов http://www.molbiol.ru, http://www.fermentas.com, портала www.pubmed.gov, базы данных BLAST (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi).

Принципы работы с молекулами ДНК. Методы выделения ДНК (щелочной, саркозиловый, фенольный, метод кипячения). Электрофоретический анализ. Подготовка проб ДНК для электрофореза. Компьютерное обеспечение для анализа электрофореграмм (программа ImageQuante).

Подходы, позволяющие улучшить качество изображения электрофореграмм. Определение концентраций препаратов ДНК путем анализа электрофореграмм, спектрофотометрического анализа. Работа с программой ImageQuante. Рестрикционный анализ. Принципы работы с ферментами рестрикции (типы рестриктаз, буферные системы, использование рестриктаз для внесения изменений в последовательности ДНК, построение рестрикционных карт). Использование ресурсов программы http://www.fermentas.com для рестрикционного анализа (характеристика ферментов рестрикции, одиночная, двойная рестрикция и др.). Получение навыков работы с каталогами. Клонирования фрагментов ДНК. Принципы клонирования фрагментов ДНК с целью дальнейшего секвенирования. Характеристика основных векторов для клонирования чужеродных молекул ДНК. Выполнение контрольных задач.

Принципы и возможности метода полимеразной цепной реакции.

Принципы проведения ПЦР. Температурные режимы ПЦР, составление программ для ПЦР. Принципы конструирования праймеров. Использование информационных ресурсов сайта http://www.molbiol.ru для конструирования праймеров. Введение сайтов рестрикции в состав последовательности праймера. Использование информации каталогов. Направленный мутагенез.

Принципы получения точечных изменений. Внесение делеций и инсерций.

Суть перекрывающейся ПЦР для получения изменений в последовательностях ДНК. Эксперименты по амплификации заданных последовательностей ДНК с целью изучения их организации. Рестрикционный анализ продуктов амплификации. Выполнения контрольных задач.

Метод секвенирования нуклеотидных последовательностей. Принципы анализа секвенированных последовательностей ДНК. Освоение программ DnaStar, VectorNTI. Построение контигов. Обнаружение открытых рамок считывания. Принципы поиска функциональных единиц (старт, стоп кодоны, RBS-cайты). Использование программы DnaStar, портала www.pubmed.gov, базы данных BLAST (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi).

Построение филогенетических древ. Использование программы DnaStar, (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi). Выполнение контрольных задач.

РАЗДЕЛ II. ЦИТОМЕТРИЯ

Введение. Три основных задачи цитометрии – документация результатов исследования, их объективизация путем измерения параметров клеток и получение невоспринимаемой глазом информации. Проточная и статическая цитометрия. Парадигма статической цитометрии. Применение цитометрии для решения типовых задач клеточной биологии: анализ клеточного цикла, улучшения дифференциальной диагностики опухолей, изучения зависимостей «доза-эффект».

Теория микроскопа. Дифракция света на круглом отверстии как физическая модель работы микроскопа. Преобразование Фурье. Минимальный микроскоп. Устройство современного светового микроскопа. Формула Аббе.

Расчет номинального разрешения объектива. Настройка освещения микроскопа по Келеру.

Фурье-анализ микроскопических изображений. Принципы получения и кодирования черно-белых и цветных изображений. Палитра цветов. Компьютерные программы анализа и обработки изображений. Программа Scion Image.

Интерпретация Фурье-образа цифровой фотографии клетки. Понятие о функции рассеяния точки (PSF) и полосы пропускания микроскопа (OTF).

Расчет соотношения “сигнал-шум” и реального разрешения микроскопа.

Анализ геометрических и яркостных параметров изображений клеток. Модель независимого распределения яркости. Гистограмма яркости изображения и ее свойства. Гамма-фактор и оптимальная настройка яркости и контраста.

Принципы сегментации изображений клеток по гистограмме яркости.

Свойства границы компактных микрообъектов.

Параметры для оценки геометрических свойств клеток – величины, формы, положения и ориентации.

Параметры для оценки интегральных яркостных свойств изображений клеток – IOD, AOD, MOD, и их интерпретация.

Анализ текстурных параметров изображений клеток. Модель локально зависимого распределения яркости и матрица GLCM. Текстурные параметры, вычисляемые по GLCM. Программа Feature Calculator для расчета текстурных параметров хроматина клеточных ядер. Интерпретация измерений текстуры хроматина.

Обработка данных в цитометрии. Особенности статистической обработки результатов измерений в цитометрии. Построение гистограмм и диаграмм рассеяния, применение методов многомерной статистики.

РАЗДЕЛ III. МИКРОГАМЕТОФИТНЫЙ ОТБОР

У РАСТЕНИЙ (ГАМЕТНАЯ СЕЛЕКЦИЯ)

Введение. Гаметная селекция. Понятие, преимущества, принципы.

Пыльца, ее строение и морфология. Фертильность, стерильность и жизнеспособность пыльцы. Выращивание пыльцы на искусственных питательных средах. Параметры пыльцы, используемые для дифференцировки генотипов.

Моделирование биотического и абиотического стрессов. Отбор устойчивых генотипов.

Подготовка материала к исследованию. Сбор и хранение пыльцы.

Приготовление реактива по рецепту Грама и раствора ацетокармина. Процедура определения фертильности пыльцы.

Оптимизация питательных сред для проращивания пыльцы. Приготовление питательных сред с разным содержанием сахарозы, хлоридов калия и кальция и агара. Процедура посева пыльцы на питательные среды и культивирование ее при оптимальной температуре. Просмотр препаратов пыльцы и снятие параметров ее жизнеспособности. Определение оптимальных сред для разных видов растений.

Индивидуальное задание. Возможные темы заданий:

1. Оценка реакции пыльцы разных видов растений на устойчивость к контрастным температурам (количество видов – по числу студентов).

2. Использование микрогаметофитного отбора для дифференцировки генотипов растений одного вида или гибридной популяции на устойчивость • биотическим стрессам (патогены);

• абиотическим стрессам (контрастным температурам, засолению и т.д.) Определить влияние абиотического стресса (температурного фактора) на процент прорастания пыльцы, длину пыльцевых трубок и процент прорастания семян, длину проростков у различных видов растений.

Приготовление оптимизированных питательных сред. Определение фертильности пыльцы. Температурное воздействие (+5°С, +24°С, +35°С) на пыльцу.

Посев пыльцы после воздействия температурой на питательную среду.

Просмотр препаратов пыльцы и определение процента ее прорастания и длины пыльцевых трубок в опыте и в контроле.

Закладка эксперимента по спорофиту. Раскладка семян в Чашки Петри.

Температурное воздействие. Длительность проращивания семян 7 дней.

Снятие параметров спорофита. Оформление протокола опыта. Расчет корреляций между параметрами гаметофита и спорофита.

Анализ результатов опыта по гаметофиту и спорофиту, определение устойчивых генотипов разных видов цветковых растений, оформление письменного отчета.

РАЗДЕЛ IV. КЛОНИРОВАНИЕ ДНК

Амплификация фрагмента ДНК, содержащего ipdС-ген бактерий Pseudomonas mendocina. Приготовление реактивов для выделение хромосомной ДНК. Выделение хромосомной ДНК по методу Мармура.

Очистка выделенной ДНК от РНК.

Проведение ПЦР с использованием стандартных праймеров для получения фрагментов ДНК, несущих ipdС-ген бактерий Pseudomonas mendocina.

Анализ амплифицированных фрагментов с помощью метода электрофореза в агарозном геле. Выделение фрагментов ДНК, несущих ipdС-ген из агарозного геля.

Выделение векторной ДНК. Приготовление реактивов для выделение плазмидной ДНК. Выделение плазмидной ДНК методом щелочного лизиса.

Очистка выделенной ДНК вектора.

Рестрикция и лигирование ПЦР-фрагментов и векторной молекулы. Рестрикция ДНК плазмиды и ПЦР-фрагментов по Bam HI-cайту. Лигирование плазмидной ДНК с фрагментами хромосомной ДНК. Контроль рестрикции и лигирования с помощью метода электрофореза в агарозном геле.

Трансформация бактерий полученной лигирующей смесью. Трансформация клеток E. coli DH5 полученной лигирующей смесью.

Отбор рекомбинантных клонов ДНК и их анализ. Расчистка полученных клонов до изолированных колоний. Высев отобранных клонов в жидкую среду для выделения плазмидной ДНК.

Выделение плазмидной ДНК методом щелочного лизиса. Анализ плазмидной ДНК, выделенной из отобранных клонов, на наличие вставки с помощью электрофореза в агарозном геле.

Изучение экспрессии клонированного гена. Выявление синтеза индолил-3-уксусной кислоты, рекомбинантными клетками E. coli с помощью реактива Сальковского. Идентификация ИУК с помощью тонкослойной хроматографии Построение рестрикционной карты клонированного фрагмента ДНК. Рестрикция полученной рекомбинантной плазмиды различными рестриктазами и их комбинацией. Анализ полученных рестриктов с помощью электрофореза в агарозном геле. Построение рестрикционной карты.

РАЗДЕЛ V. ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ

Введение. Базовая схема полимеразной цепной реакции. Технологические стадии полимеразной цепной реакции. Цикличность полимеразной цепной реакции, этапы индивидуальных циклов. Основные модификации базовой схемы полимеразной цепной реакции и их использование в фундаментальных и прикладных исследованиях.

Разработка праймеров. Праймеры как затравки для матричного синтеза комплементарных цепей ДНК с помощью термостабильных ДНКполимераз в полимеразной цепной реакции. Основные структурнотермодинамические характеристики праймеров.

Построение модели целевых генов с помощью геномных браузеров.

Разработка праймеров с помощью пакетов компьютерных программ Hybrid и Mfold. Использование программы PerlPrimer при моделировании структуры праймеров. Оценка специфичности праймеров с помощью программы BLASTn.

Экспериментальная проверка специфичности и эффективности праймеров, предназначенных для полимеразной цепной реакции.

Подготовка ДНК-матрицы для полимеразной цепной реакции. Основные источники получения ДНК-матриц, используемых в полимеразной цепной реакции. Качественные и количественные требования, предъявляемые к исходной ДНК-матрице.

Выделение тотальной РНК из клеток человека методом TRIZol-ной экстракции. Очистка тотальной клеточной РНК. Количественный анализ тотальной клеточной РНК с помощью спектрофотометрии. Качественный анализ препарата клеточной РНК с помощью гель-электрофореза.

Синтез комплементарной ДНК с помощью реакции обратной транскрипции на РНК-матрице. Критические параметры, влияющие на эффективность синтеза комплементарной ДНК. Разновидности праймеров, предназначенных для реакции обратной транскрипции.

Выделение геномной ДНК из клеток человека методом TRIZol-ной экстракции. Очистка геномной ДНК. Количественный анализ геномной ДНК с помощью спектрофотометрии. Качественный анализ препарата геномной ДНК с помощью гель-электрофореза.

Полимеразная цепная реакция. Критические параметры, влияющие на специфичность (селективность), эффективность (выход конечного продукта) и правильность (точность) полимеразной цепной реакции. Пути оптимизации компонентного состава реакционной смеси для полимеразной цепной реакции. Термостабильные ДНК-полимеразы. Программа амплификации и ее оптимизация. Термоциклеры (амплификаторы).

Подготовка реакционной смеси для полимеразной цепной реакции.

Амплификация специфических регионов целевых генов. Особенности проведения полимеразной цепной реакции при использовании в качестве матрицы комплементарной ДНК или геномной ДНК.

Визуализация и анализ продуктов полимеразной цепной реакции. Разделение продуктов полимеразной цепной реакции с помощью гель-электрофореза. Основные методы визуализации продуктов амплификации. Документация и анализ результатов полимеразной цепной реакции.

УЧЕБНО-МЕТОДИЧЕСКАЯ КАРТА

Номер раздела, темы, занятия

МОЛЕКУЛЯРНАЯ ГЕНЕТИКА

Приготовление растворов. Подготовка оборудования. Знакомство с компьютерным обеспечением.

II. ЦИТОМЕТРИЯ

1.1. Дифракция света на круглом отверстии. Преобразо- 2 терный препараты, ком- задания.

1.2. Настройка микроскопа по Келеру. Определение номинального разрешения объективов по формуле Аббе. Типовые задачи цитометрии.

1.3. Аппаратное и программное обеспечение цитомет- рии. Получение цифровых изображений клеток.

Калибровка микроскопа по полю и глубине.

Фурье-анализ микроскопических изображений. Компью- Методические ЛО 4, 5, 6 Контрольные Интерфейс программы Scion Image. Фурье-образ цифрового снимка клетки и его расшифровка. анализ. вые изображения Понятие о функции рассеяния точки (PSF) и поклеток. Програмлосе пропускания микроскопа (OTF). Расчет со- ма Scion Image.

отношения “сигнал-шум”. Измерение разрешающей способности микроскопа.

Коррекция регулярного и случайного шума путем цифровой фильтрации изображений.

Анализ геометрических и яркостных парамет- Компью- Презентация Van ЛО 17, 18, 33 Контрольные Гистограмма яркости изображения и ее свойства.

Сегментация изображений по гистограмме ярко- 3.2.

Измерение геометрических и яркостных парамет- 3.3.

ров изображений клеток. Статистическая обработка результатов.

Понятие о текстуре. Матрица взаимной вероятноанализ. Программа Feaсти яркости (GLCM) и ее свойства. ture Calculator.

Измерение текстурных параметров клеток, их обработка и интерпретация результатов 5.1.

III. МИКРОГАМЕТОФИТНЫЙ ОТБОР У

РАСТЕНИЙ (ГАМЕТНАЯ СЕЛЕКЦИЯ)

пыльцы. Выращивание пыльцы на искусственных питательных средах. Параметры пыльцы, используемые для дифференцировки генотипов. Моделирование биотического и абиотического стрессов. Отбор устойчивых генотипов.

2.2 Процедура определения фертильности пыльцы 1 лед. уксусная к та Оптимизация питательных сред для проращи- 3.2 Процедура посева пыльцы на питательные среды 2 pHметр, ров ее жизнеспособности. Определение оптимальных сред для разных видов растений.

4.1 Приготовление питательных сред. Определение 2 Вод. баня, фертильности пыльцы. Температурное воздейст- pHметр, Просмотр препаратов пыльцы и определение про- 4 Программируемый научный 4.3 цента ее прорастания и длины пыльцевых трубок 4.4 Закладка эксперимента по спорофиту. Раскладка семян в Чашки Петри. Температурное воздействие. Длительность проращивания семян 7 дней.

4.5. Снятие параметров спорофита. Оформление про- токола опыта. Расчет корреляций между параметрами гаметофита и спорофита 4.6. Анализ результатов опыта по гаметофиту и спорофиту, определение устойчивых генотипов раз- ных видов цветковых растений и оформление письменного отчета.

IV. КЛОНИРОВАНИЕ ДНК

1. Амплификация фрагмента ДНК, содержащего ipdС-ген бактерий Pseudomonas mendocina/ 1.1. Приготовление реактивов для выделение хромо- 2 ПЦР, среды и ЛД 10, 11, 1.2. Выделение хромосомной ДНК по методу Марму- ра. Очистка выделенной ДНК от РНК.

1.3. Проведение ПЦР с использованием стандартных праймеров для получения фрагментов ДНК, несущих ipdС-ген бактерий Pseudomonas mendocina.

1.3. Анализ амплифицированных фрагментов с помо- щью метода электрофореза в агарозном геле.

1.4. Выделение фрагментов ДНК, несущих ipdС-ген из агарозного геля.

2. Выделение плазмидной ДНК (получение век- 2.1. Приготовление реактивов для выделение плаз- 2.2. Выделение плазмидной ДНК методом щелочного 3. Рестрикция и лигирование ПЦР-фрагментов и векторной молекулы.

3.1. Рестрикция ДНК плазмиды и ПЦР-фрагментов 2 электрофореза. ЛД 10, 11, 3.2. Лигирование плазмидной ДНК с фрагментами хромосомной ДНК.

3.3. Контроль рестрикции и лигирования с помощью метода электрофореза в агарозном геле.

4. Трансформация бактерий полученной лиги- 5. Отбор рекомбинантных клонов ДНК и их ана- 5.1. Расчистка полученных клонов до изолированных 2 электрофореза. ЛД 10, 11, 5.2. Высев отобранных клонов в жидкую среду для выделения плазмидной ДНК.

5.3. Выделение плазмидной ДНК методом щелочного 5.4. Анализ плазмидной ДНК, выделенной из ото- бранных клонов, на наличие вставки с помощью электрофореза в агарозном геле.

6. Изучаение экспрессии клонированного гена. 6.1. Выявление синтеза индолил-3-уксусной кислоты, 4 вы, пластинки 12, 20, 24 опыта.

рекомбинантными клетками E. coli с помощью для хроматорга- ЛД 10, 11, 6.2. Идентификация ИУК с помощью тонкослойной хроматографии 7. Построение рестрикционной карты клониро- ванного фрагмента ДНК.

Рестрикция полученной рекомбинантной плазми- 4 рат для электроды различными рестриктазами и их комбинацией. фореза.

Анализ полученных рестриктов с помощью элек- 7.2.

трофореза в агарозном геле.

7.3.

V. ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ

видуальных циклов. Основные модификации базовой схемы полимеразной цепной реакции.

2.1. Требования, предъявляемые к праймерам. Основное 2 выходом в Inter- 26, 28, 29, 30, опыта.

2.2. Построение компьютерных моделей целевых ге- 2.3. Компьютерное моделирование праймеров для по- лимеразной цепной реакции.

Подготовка ДНК-матрицы для полимеразной цепной реакции.

3.1. Принципы работы с культурами клеток млекопи- 2 Лабораторное 3.2. Выделение тотальной РНК из клеток человека ме- 4 Методическое 3.3. Количественный и качественный анализ тоталь- ной клеточной РНК с помощью спектрофотометрии и гель-электрофореза.

3.4. Синтез комплементарной ДНК с помощью реак- ции обратной транскрипции на РНК-матрице.

3.5. Выделение геномной ДНК из клеток человека ме- тодом TRIZol-ной экстракции. Очистка геномной 3.6. Количественный и качественный анализ геномной ДНК с помощью спектрофотометрии и гельэлектрофореза.

4.2. Амплификация специфических регионов целевых 6 оборудование.

5. Визуализация и анализ продуктов полимераз- ной цепной реакции (6 ч).

5.1. Разделение продуктов полимеразной цепной ре- 4 Лабораторное 5.2. Визуализация продуктов амплификации, доку- 2 Методическое ментация и анализ результатов полимеразной пособие.

цепной реакции.

Основная (ЛО) 1 Анохина, В. С. Оценка селекционных образцов люпина уз- колистного на устойчивость к фузариозу по их спорофиту и гаметофиту.

2 Введение в технику полимеразной цепной реакции: Методи- ческое пособие к лабораторным занятиям по специальному практикуму для студентов биологического.

3 Глик, Б. Молекулярная биотехнология. Принципы и приме- 4 Глушен, С. В. Введение в микроскопию. Методические ука- зания для студентов биологического факультета.

6 Глушен, С. В. Программа Scion Image. Методические указа- ния для студентов биологического факультета БГУ.

8 Кильчевский, А. В. Гаметная и зиготная селекция растений. 9 Кильчевский, А. В. Изучение корреляционных связей между признаками спорофита и гаметофита томата в диаллельных скрещиваниях.

10 Кильчевский, А. В. Использование гаметофитного отбора для оценки устойчивости селекционных форм томата к грибным болезням.

12 Маниатис, Т. Методы генетической инженерии. Молеку- лярное клонирование.

13 Методические указания по гаметной селекции сельскохо- зяйственных растений.

15 Патрушев, Л. И. Искусственные генетические системы. 18 Розенфельд, А. Распознавание и обработка изображений. 21 Сорока, А. И. Микрогаметофитный отбор на устойчивость к температурному фактору у кукурузы.

25 Янковский, Н. К. Конструирование и анализ клонотек гено- 26 Alkami Quick Guide™ for PCR. A laboratory reference for the polymerase chain reaction.

27 Boavida, L. S. Temperature as a determinant factor for increased and reproducible in vitro pollen germination in Arabidopsis thaliana.

30 Markham, N. R. DINAMelt web server for nucleic acid melting prediction.

31 McGinnis, S. BLAST: at the core of a powerful and diverse set of sequence analysis tools.

32 Sambrook, J. Molecular cloning: A laboratory manual. 33 Vliet, L. J. Digital image analysis for microscopy. 34 Walker, R. F. Adaptive multi-scale texture analysis with applica- tion to automated cytology.

Дополнительная (ЛД) 1 База данных GenBank: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank 2 База данных PubMed: http://www.pubmed.gov 3 База данных RefSeq: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq 4 Геномный браузер Ensembl: http://www.ensembl.org 5 Геномный браузер UCSC: http://genome.ucsc.edu 6 Информационные ресурсы сайта: http:// www.maizegdb.org 7 Информационные ресурсы сайта: http:// www.molbiol.ru 8 Информационные ресурсы сайта: http:// www.fermentas.com 9 Информационные ресурсы сайта: http:// www.plantcell.org 12 Сервер The Mfold web server:

http://www.bioinfo.rpi.edu/applications/mfold 13 Сервер The DINAMelt web server:

http://www.bioinfo.rpi.edu/applications/hybrid 16 Johnson-Brousseau, S. A. A compendium of methods useful for characterizing Arabidopsis pollen mutants and gametophytically-expressed genes.

17 Nucleic acid amplification. Protocols and applications guide from Promega.

18 NSBI BLAST: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST OligoAnalyzer 3.0:

19 http://www.idtdna.com/analyzer/Applications/ OligoAnalyzer Web Primer: http://seq.yeastgenome.org/cgi-bin/web-primer 20 Zuker, M. Mfold web server for nucleic acid folding and hy- bridization prediction.

ПРОТОКОЛ СОГЛАСОВАНИЯ УЧЕБНОЙ ПРОГРАММЫ

ПО ИЗУЧАЕМОЙ УЧЕБНОЙ ДИСЦИПЛИНЕ

С ДРУГИМИ ДИСЦИПЛИНАМИ СПЕЦИАЛЬНОСТИ

ДОПОЛНЕНИЯ И ИЗМЕНЕНИЯ К УЧЕБНОЙ ПРОГРАММЕ

ПО ИЗУЧАЕМОЙ УЧЕБНОЙ ДИСЦИПЛИНЕ

Учебная программа пересмотрена и одобрена на заседании кафедры (протокол № от 20 г.) Заведующий кафедрой _ _

УТВЕРЖДАЮ

Декан факультета _ _ При наличии предложений об изменениях в содержании учебной программы по изучаемой учебной дисцип- лине

 


Похожие работы:

«Пояснительная записка Рабочая программа составлена на основе Федерального Государственного стандарта, Примерной программы среднего (полного) общего образования (профильный уровень) и программы среднего (полного) общего образования по биологии для 10 – 11 классов (профильный уровень) авторов О.В. Саблиной, Г.В. Дымшица На изучение биологии в 10 - 11 классах отводится 204 часов, 3 часа в неделю. В данной программе нашли отражение цели и задачи изучения биологии на ступени среднего (полного)...»

«МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования ПЕРМСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ГЕОГРАФИЧЕСКИЙ ФАКУЛЬТЕТ ПРОГРАММА вступительного экзамена Природопользование для поступающих в магистратуру по направлению 022000.68 ЭКОЛОГИЯ И ПРИРОДОПОЛЬЗОВАНИЕ (магистерская программа Устойчивое развитие и охрана природы) Программа составлена в соответствии с...»

«1 ПРОГРАММА ВСТУПИТЕЛЬНЫХ ИСПЫТАНИЙ в аспирантуру по научной специальности 14.03.10 КЛИНИЧЕСКАЯ ЛАБОРАТОРНАЯ ДИАГНОСТИКА Санкт-Петербург 2014 Программа составлена в соответствии с программой подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре по специальности Клиническая лабораторная диагностика, программой – минимум кандидатского экзамена по специальности Клиническая лабораторная диагностика, утвержденной приказами Министерства образования и науки РФ № 274 от 08.10.2007 г. и программой...»

«Правительство Республики Казахстан Программа Развития ООН В сотрудничестве с Комитетом лесного и охотничьего хозяйства МСХ РК Министерством сельского хозяйства РК Министерством охраны окружающей среды РК Акиматом Алматинской области Компанией Балдырган Компанией Жибек Жолы Ин-ситу сохранение горного агробиоразнообразия в Казахстане Номер проекта: Краткое описание: Цель данного проекта заключается в сохранении in-situ и устойчивом использовании биологического разнообразия, имеющего глобальное...»

«ПРИНЯТА УТВЕРЖДЕНА решением педагогического совета приказом директора МБОУ школы Средняя общеобразовательная Протокол №1 от 30 августа 2013 года школа №11 приказ №115 от 30 августа 2013 РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ПО БИОЛОГИИ для 5А, Б классов 2013\2014 учебный год В основе рабочей программы лежит авторская программа, разработанная коллективом авторов под руководством В. В. Пасечника Допущено Министерством образования и науки РФ Разработчик программы - учитель русского языка и литературы Шитова Елена...»

«МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования Кемеровский государственный университет Новокузнецкий институт (филиал) Факультет информационных технологий Кафедра экологии и естествознания УТВЕРЖДАЮ Декан ФИТ Каледин В.О. 14 марта 2013 г. РАБОЧАЯ ПРОГРАММА учебной дисциплины ОПД.Ф.02 Общая экология Для специальности 020804.65 Геоэкология Специализация 013602 Региональное...»

«МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования Оренбургская государственная медицинская академия Министерства здравоохранения Российской Федерации Кафедра философии УТВЕРЖДАЮ проректор по научной и клинической работе профессор Н.П. Сетко 20_ г. РАБОЧАЯ ПРОГРАММА дисциплины ИСТОРИЯ И ФИЛОСОФИЯ НАУКИ основной профессиональной образовательной программы послевузовского профессионального образования...»

«ЮГО-ЗАПАДНОЕ ОКРУЖНОЕ УПРАВЛЕНИЕ ОБРАЗОВАНИЯ ДЕПАРТАМЕНТА ОБРАЗОВАНИЯ ГОРОДА МОСКВЫ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ГОРОДА МОСКВЫ СРЕДНЯЯ ОБЩЕОБРАЗОВАТЕЛЬНАЯ ШКОЛА С УГЛУБЛЕННЫМ ИЗУЧЕНИЕМ ОБЛАСТИ ЗНАНИЙ ИСКУССТВО № 1372 РАБОЧАЯ ПРОГРАММА по биологии, 6 класс на 2013-2014 год Ушаковой Елены Владимировны учителя первой квалификационной категории Курс Растения. Бактерии. Грибы. Лишайники. (34 часа. 1 час в неделю) Авторы: И.Н. Пономарева, О.А. Корнилова, В.С. Кучменко. Москва....»

«МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РФ Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования Тверской государственный университет Биологический факультет Кафедра Ботаники УТВЕРЖДАЮ Декан факультета _ 2013 г. Рабочая программа дисциплины Экология и рациональное природопользование Для студентов III курса Направление подготовки 020400.62 БИОЛОГИЯ Профиль подготовки – Биоэкология, Ботаника, Общая биология, Физиология человека Квалификация (степень)...»

«Е.И. ГОЛУБЕВА Доктор биологических наук, профессор кафедры рационального природопользования географического факультета МГУ имени М.В.Ломоносова Т.О. КОРОЛЬ Кандидат географических наук, старший научный сотрудник кафедры рационального природопользования географического факультета МГУ имени М.В.Ломоносова НОВАЯ ОБРАЗОВАТЕЛЬНАЯ ПРОГРАММА ПОДГОТОВКИ СПЕЦИАЛИСТОВ В СФЕРЕ ЛАНДШАФТНО-ЭКОЛОГИЧЕСКОГО ПЛАНИРОВАНИЯ РАЗВИТИЯ ТЕРРИТОРИЙ. В течение последних десятилетий тенденцией развития образования...»

«1 ПОЯСНИТЕЛЬНАЯ ЗАПИСКА В настоящее время в школе существует предпрофильная и профильная подготовка учащихся. В ходе предпрофильной подготовки особенно важны факультативы, кружки, внеклассные мероприятия, которые позволят школьнику сориентироваться в огромной массе научной информации и выбрать научное направление наиболее близкое и понятное ему. Именно это направление может стать основным профилем, который будет выбран учащимся позже и возможно станет основой для будущей профессиональной...»

«Программа дисциплины Количественные методы в ландшафтно-геоэкологических исследованиях Авторы: с.н.с., к.г.н. Кондратьева Т.И., с.н.с., к.г.н. Фортыгина Е.А. Цель освоения дисциплины изучение современных количественных и качественных методов и практических навыков покомпонентной и комплексной оценки состояния ландшафтов, природно-ресурсного потенциала территории, освоение современного арсенала методологических приемов управления природопользованием. Задачи: - знакомство студентов с общими...»

«Рассмотрено Согласовано Утверждаю на заседании МО учителей математики и естественных наук Зам. директора по УВР Директор МБОУ Орловской СОШ Ефанова И. А. Л.А.Ермолова Протокол №1 от 29.08.2013г. 30 августа 2013 г. Приказ №_42/10 от 31 августа2013 г. Руководитель МО Т.Я.Ефанова 29августа 2013г. 2013 -2014 учебный год РАБОЧАЯ ПРОГРАММА ПО БИОЛОГИИ класс 6_ учитель Казьмина Л. В. количество часов в год количество часов в неделю 2_(1 час из федерального и 1 час из регионального компонента)_...»

«ПОЯСНИТЕЛЬНАЯ ЗАПИСКА Рабочая программа по биологии разработана в соответствии с федеральным компонентом государственного стандарта общего образования (Приказ МО России от 05.03.2004г. № 1089), программой среднего (полного) общего образования по биологии.10-11 классы. Профильный уровень (автор В.Б. Захаров), Дрофа 2010 год Рабочая программа ориентирована на учебник: Захаров В.Б., Мамонтов С.Г., Сонин Н.И. Общая биология 11 класс. Профильный уровень. Ч. 1 /Под ред. проф. В.Б. Захарова. - М.:...»

«Программа Организации Объединенных Главное Управление по гидрометеорологии Наций по окружающей среде при Кабинете Министров (ЮНЕП) Республики Узбекистан (ГЛАВГИДРОМЕТ) НАЦИОНАЛЬНАЯ ПРОГРАММА ДЕЙСТВИЙ ПО БОРЬБЕ С ОПУСТЫНИВАНИЕМ В РЕСПУБЛИКЕ УЗБЕКИСТАН Ташкент 1999 г. Подготовлена координационным комитетом по разработке Национальной программы действий по борьбе с опустыниванием при финансовой поддержке Программы ООН по окружающей среде (ЮНЕП) и техническом содействии Программы развития ООН...»

«МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ПРОФЕССИОНАЛЬНОГО ОБРАЗОВАНИЯ ТВЕРСКОЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ УДК 58.006; 378.4 (470. 331) Код ГРНТИ 34.35.01; 34.29.15 УТВЕРЖДАЮ Проректор по НИД Тверского государственного университета д.т.н., Каплунов И.А. _ 16 декабря 2013 г. М.П. ОТЧЕТ По программе стратегического развития федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего...»

«1 ПРОГРАММА ВСТУПИТЕЛЬНОГО ЭКЗАМЕНА в аспирантуру по научной специальности 14.00.36 АЛЛЕРГОЛОГИЯ И ИММУНОЛОГИЯ Санкт-Петербург 2014 Программа составлена в соответствии с программами высшего профессионального образования по специальностям Лечебное дело и Педиатрия, а также программой дополнительного профессионального образования по специальности Аллергология и иммунология. 1. ОБЩИЕ ПОЛОЖЕНИЯ Программа вступительного экзамена составлена на основании федеральных государственных требований к...»

«УТВЕРЖДАЮ МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ОБРАЗОВАНИЯ Ректор РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ _ И.Р. Гафуров ФГАОУВПО 2014 г. Казанский (Приволжский) федеральный университет Программа вступительного испытания по направлению 20.04.02 Природообустройство и водопользование, магистерская программа Урбоэкология Программа вступительного испытания (письменные ответы на вопросы) Взаимодействие организма и среды. Уровни биологической организации. Источники энергии для организмов. Автотрофы и гетеротрофы. Трофические...»

«МИНОБРНАУКИ РОССИИ Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования Горно-Алтайский государственный университет (Горно-Алтайский государственный университет, ГАГУ) Утверждаю: Ректор В.Г.Бабин 24 ноября 2011 г. Номер внутривузовской регистрации Основная образовательная программа высшего профессионального образования Направление подготовки 020400.68 Биология Профиль подготовки Экология Квалификация (степень) Магистр Форма обучения очная...»

«МИНИСТЕРСТВО ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования Оренбургская государственная медицинская академия Министерства здравоохранения Российской Федерации Кафедра истории Отечества УТВЕРЖДАЮ Проректор по научной и клинической работе профессор Н.П. Сетко 20_ г. РАБОЧАЯ ПРОГРАММА дисциплины ПЕДАГОГИКА И ПСИХОЛОГИЯ ВЫСШЕЙ ШКОЛЫ основной профессиональной образовательной программы послевузовского...»








 
© 2013 www.diss.seluk.ru - «Бесплатная электронная библиотека - Авторефераты, Диссертации, Монографии, Методички, учебные программы»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.