WWW.DISS.SELUK.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА
(Авторефераты, диссертации, методички, учебные программы, монографии)

 

На правах рукописи

ХАРЗИНОВА Вероника Руслановна

ИЗУЧЕНИЕ ГЕНОТИПОВ ДНК-МАРКЕРОВ

GH, DGAT1 И TG5 В СВЯЗИ С ЛИНЕЙНОЙ

ПРИНАДЛЕЖНОСТЬЮ И УРОВНЕМ МОЛОЧНОЙ

ПРОДУКТИВНОСТИ КОРОВ ЧЕРНО-ПЕСТРОЙ

ПОРОДЫ

Специальность: 03.02.07 – ГЕНЕТИКА

АВ Т ОР ЕФЕ Р АТ

диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

-п. Дубровицы, 2011 г.

Работа выполнена в Центре биотехнологии и молекулярной диагностики животных ГНУ Всероссийский научно-исследовательский институт животноводства Российской академии сельскохозяйственных наук.

доктор биологических наук,

Научный руководитель:

профессор, член-корреспондент РАСХН Зиновьева Наталия Анатольевна доктор биологических наук, профессор

Официальные оппоненты:

Букаров Нурмагомед Гаджикулиевич доктор биологических наук Субботин Александр Данилович Ведущее учреждение – ФГОУ ВПО Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии имени К.И. Скрябина.

Защита состоится июня 2011 года, в 10 часов, на заседании совета по защите докторских и кандидатских диссертаций Д 006.013.03 при ГНУ Всероссийский научно-исследовательский институт животноводства Российской академии сельскохозяйственных наук.

Адрес института: 142132, Московская область, Подольский район, пос. Дубровицы, ГНУ ВИЖ.

т/факс (4967)

С диссертацией можно ознакомиться в научной библиотеке ГНУ ВИЖ Россельхозакадемии.

Автореферат разослан «» мая 2011 года.

Ученый секретарь Совета Д 006.013.03 И.В. Гусев 1. ВВЕДЕНИЕ Актуальность темы. Повышение уровня молочной продуктивности является одной из основных целей селекции пород скота молочного направления продуктивности (Стрекозов Н.И. и др., 2006). В качестве дополнительного критерия отбора, в этой связи, рассматривается использование генотипа животных по ДНК-маркерам, что позволит перевести селекционный процесс на принципиально новый уровень (Калашникова Л.А., Дунин М.И., Глазко В.И., 2000). Функциональными генами-кандидатами молочной продуктивности коров (уровня удоя, содержания молочного жира и белка) считаются гены гормона роста (GH), диацилглицерол О-ацилтрансферазы (DGAT1) и тиреоглобулина (TG5) (Dybus А., 2002, Winter et.al., 2002, Pawar R.S., 2007, Casas et al., 2007, Михайлова М.Е., 2008). Выбор вышеназванных генов в качестве ДНКмаркеров обусловлен участием кодируемых ими белков в процессах формирования отдельных компонентов молока.





Неотъемлемым элементом управления процессом совершенствования стад по племенным и продуктивным качествам в ряде предприятий является создание и поддержание определенной линейной структуры. В этой связи, аллелофонд животных по ДНК-маркерам следует рассматривать не только в масштабах стада в целом, но и в аспекте отдельных генеалогических линий.

Такой подход обеспечит возможность проведения отбора животных с учетом генотипа по ДНК-маркерам при сохранении заданной линейной структуры стада. Исходя из вышеизложенного, актуальным является изучение генотипов ДНК-маркеров GH, DGAT1 и TG5 в связи с линейной принадлежностью и уровнем молочной продуктивности коров.

Цель и задачи исследования. Целью настоящей работы является изучение генотипов ДНК-маркеров GH, DGAT1 и TG5 в связи с линейной принадлежностью и уровнем молочной продуктивности коров черно-пестрой породы.

Для достижения поставленной цели были решены следующие задачи:

1. Изучить уровень молочной продуктивности коров черно-пестрой породы различных генеалогических линий.

2. Выполнить анализ распределения генотипов и аллелей ДНКмаркеров GH, DGAT1 и TG5 в изучаемой выборке коров.

3. Оценить генетическую структуру генеалогических линий коров по изучаемым ДНК-маркерам.

4. Выполнить анализ связи генотипов ДНК-маркеров GH, DGAT1 и TG5 с показателями молочной продуктивности коров черно-пестрой породы.

5. Установить связи между распределением мультилокусных генотипов по изучаемым ДНК-маркерам и уровнем молочной продуктивности коров различных генеалогических линий.

Научная новизна исследований. Изучен аллелофонд коров чернопестрой породы по ДНК-маркерам GH, DGAT1 и TG5 в аспекте отдельных генеалогических линий. Показано, что мультилокусный подход к анализу генетической структурированности стада приводит к более четкой линейной дифференциации по сравнению с подходом, основанным на рассмотрении каждого из изучаемых локусов в отдельности. Установлены зависимости между распределением мультилокусных генотипов по изучаемым ДНКмаркерам в генеалогических линиях и показателями молочной продуктивности коров.

Практическая значимость. Дана характеристика уровня молочной продуктивности коров черно-пестрой породы различной линейной принадлежности. Установлено достоверное положительное влияние генотипов изучаемых ДНК-маркеров на показатели молочной продуктивности коров: генотипа VV по GH – на уровень удоя и количество молочного белка по 3-й лактации (p0,05), генотипа СТ по TG5 - на количество молочного жира по 2-й лактации (p0,05). Выявлены мультилокусные генотипы, достоверно коррелирующие с показателями молочной продуктивности первотелок различных генеалогических линий:





генотип LL/AA/CC - с уровнем удоя (p0,05), генотип LV/AA/CC - с содержанием жира в молоке (p0,01).

Основные положения, выносимые на защиту:

Аллельные профили коров черной пестрой породы различных генеалогических линий по ДНК-маркерам GH, DGAT1 и TG5.

Мультилокусный подход в оценке генетической структуры стада.

Влияние генотипов по GH и TG5 на показатели молочной продуктивности коров.

Связь некоторых мультилокусных генотипов изучаемых ДНКмаркеров с показателями молочной продуктивности коров различных генеалогических линий.

Апробация работы. Результаты исследований были доложены и обсуждены на следующих конференциях:

международной научно-практической конференции «Проблемы увеличения производства продуктов животноводства и пути их решения», Дубровицы, ГНУ ВИЖ Россельхозакадемии, 2008 г;

7-ой международной научной конференции-школе «Современные достижения и проблемы биотехнологии сельскохозяйственных животных:

роль нанотехнологий в реализации приоритетных задач биотехнологии»

«БиоТехЖ-2008», Дубровицы, ГНУ ВИЖ Россельхозакадемии, 2008 г.;

международной научной конференции, посвященной 100-летию со дня рождения основателя института, заслуженного деятеля науки РСФСР, профессора М.М. Лебедева «Достижения в генетике, селекции и воспроизводстве сельскохозяйственных животных», С-Петербург, ВНИИГРЖ, 2009 г.;

международной конференции «ЕС – Россия: 7-я Рамочная программа в области биотехнологии, сельского, лесного, рыбного хозяйства и пищи», Башкирский ГАУ, 2010 г.

Структура и объем работы. Диссертация написана на 115 страницах, состоит из следующих разделов: введение, обзор литературы, материалы и методы исследований, результаты и обсуждение, выводы, практические предложения, список литературы. Диссертационная работа содержит таблиц и 18 рисунков. Список литературы включает 128 источников, в том числе 90 источников на иностранном языке.

Публикации результатов исследований. По материалам диссертации опубликовано 6 научных работ, в том числе 2 статьи в журналах, рекомендованных ВАК РФ (Зоотехния, Проблемы биологии продуктивных животных).

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

Исследования проводили в лаборатории молекулярной генетики и цитогенетики животных Центра биотехнологии и молекулярной диагностики животных ГНУ ВИЖ Россельхозакадемии в период с 2007 по 2011 гг.

согласно схеме (рис. 1).

Характеристика уровня молочной продуктивности коров черно-пестрой породы различных Анализ распределения частот встречаемости генотипов и аллелей ДНК-маркеров Аллельные профили коров генеалогических линий по изучаемым ДНК – маркерам (Ne) Изучение уровня гетерозиготности популяции по ДНК – маркерам (Ho, He, Fis) Изучение генетических параметров ДНК-маркеров и генеалогических линий коров чернопестрой породы (Fis, Fit, Fst, Nm) Анализ частот встречаемости мультилокусных генотипов ДНК-маркеров для коровразличной Изучение связи генотипов исследуемых генов с уровнем молочной продуктивности В эксперименте были исследованы коровы черно-пестрой породы (n=280) экспериментального хозяйства ФГУП «Кленово-Чегодаево»

следующих 8-и генеалогических линий: Монтвик-Чифтейна, МЧ (n=46), Рефлекшен Соверинга, РС (n=93), Рамандейл Шаммар Гениуса, РШГ (n=5), Уес Идеала, УИ (n=69), Франса, Ф (n=14), Силинг Трайджут Рокита, СТР (n=24), Вис Бэк Айдиала 10134, ВБА (n=25), Файнтелекс Грейлита, ФГ (n=4).

Материалом для молекулярно-генетических исследований служили пробы ткани коров (ушной выщип). Выделение ДНК проводили с помощью колонок фирмы Nexttec (Германия). Анализ ДНК и постановку ПЦР проводили согласно «Методическим рекомендациям по использованию метода полимеразной цепной реакции в животноводстве» (Зиновьева Н.А. и др., 1998). Анализ полиморфизма изучаемых ДНК-маркеров выполняли по методикам Центра биотехнологии и молекулярной диагностики животных ГНУ ВИЖ.

На основании данных анализа генотипа коров по изучаемым ДНКмаркерам проводили построение и анализ аллельных профилей, определение наблюдаемого (Ho) и ожидаемого (He) уровней гетерозиготности, расчет популяционно-генетических параметров генеалогических линий коров черно-пестрой породы (индексы фиксации Fis, Fit, Fst и число мигрантов Nm). На основе частот встречаемости аллелей по исследуемым ДНКмаркерам, между отдельными линиями коров рассчитывали показатели стандартной генетической дистанции (Nei M., 1983), а на основе частот встречаемости мультилокусных генотипов проводили расчет Евклидовых дистанций. Для оценки устойчивости топологии дендрограмм рассчитывали бут-стреп вероятности формирования каждой «ветви» (использовано псевдовыборок) с помощью программы PAST v.1.82b. Статистическую обработку данных генотипирования и зоотехнического учета проводили по стандартным методикам (Вейр Б., 1995, Животовский Л.А., 1991, Меркурьева Е.А. и др., 1991) с использованием программ Microsoft Excel, Statistica for Windows, Version 5.0. Достоверность разницы между животными с разными генотипами была оценена с помощью критерия Фишера на основе однофакторного дисперсионного анализа.

3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1. Анализ показателей молочной продуктивности изучаемой выборки коров черно-пестрой породы ФГУП «Кленово-Чегодаево»

Результаты анализа удоя коров черно-пестрой породы различной линейной принадлежности за 305 дней 1-3 лактаций обобщены в таблице 1.

Как следует из данных таблицы 1, наивысший удой по результатам 1-й лактации был отмечен у коров линий ВБА и СТР – 6701,0 и 6699,0 кг, соответственно, наименьший - у коров линии Ф. По итогам 2- и 3-й лактаций наивысшим удоем характеризовались коровы линии УИ (7235,6 и 8140,8 кг, соответственно). Наименьшие уровни удоев по результатам 2- и 3-й лактаций отмечались у коров линии Ф (6157 кг) и ФГ (6730 кг), соответственно.

Удой коров черно-пестрой породы различной линейной принадлежности за Линия

X SX X SX X SX

МЧ 46 6609±139 14,3 37 7174±191 16,3 20 7723±492 28, Ф 14 5497±275 18,7 14 6157±324 19,7 12 6926±345 17, РС 93 6540±98 14,5 53 7157±168 17,1 24 7813±202 12, УИ 69 6421±117 15,1 36 7236±196 16,3 17 8141±235 11, ВБА 25 6701±233 17,0 21 7137±296 19,0 6 7568±672 21, СТР 24 6699±156 11,4 13 6987±319 16,4 6 7099±740 25, Анализ показателей содержания жира в молоке коров изучаемых линий (табл. 2) показал наивысшее значение данного показателя по 1-й лактации у коров линий СТР и ВБА (4,26 и 4,22%, соответственно), по 2-й лактации – у коров линии Ф (4,26%), по 3-й лактации – у коров МЧ (4,28%). Наименьшие значения содержания жира в молоке по 1-, 2- и 3-й лактациям отмечены у коров линий УИ (3,91%), ФГ (3,76%) и ВБА (3,75%).

Содержание жира в молоке коров черно-пестрой породы различной линейной принадлежности за 305 дней лактации Линия

X SX X SX X SX

МЧ 46 4,08±0,05 8,2 37 4,17±0,06 8,9 20 4,28±0,09 9, РС 93 4,15±0,03 6,6 53 4,20±0,05 9,5 24 4,09±0,09 10, ВБА 25 4,22±0,08 9,9 21 4,22±0,08 8,3 6 3,75±0,17 11, Результаты анализа содержания белка в молоке разных генеалогических линий изложены в таблице 3.

Наивысшее значение данного показателя по 1-й лактации выявлено у коров линий ВБА (3,12%) и СТР (3,11%), по 2-й лактации – у коров линии ФГ (3,18%), по 3-й лактации – у коров ФГ (3,46%). Наименьшие значения показателя молочного белка по 1-, 2- и 3-й лактациям отмечены у коров линий Ф (2,95%), РШГ (2,90%) и Ф (2,93%) Содержание белка в молоке коров черно-пестрой породы различной линейной принадлежности за 305 дней лактации Линия

X SX X SX X SX

МЧ 43 3,00±0,03 6,07 33 3,06±0,04 6,78 18 3,04±0,04 5, Ф 10 2,95±0,04 4,4 13 3,05±0,04 4,8 11 2,93±0,05 5, РС 90 3,09±0,02 5,1 51 3,14±0,03 6,1 23 3,07±0,04 6, УИ 66 3,08±0,02 5,6 35 3,06±0,04 8,2 16 3,01±0,03 4, ВБА 23 3,12±0,03 5,0 19 3,14±0,05 7,0 5 3,13±0,09 6, СТР 24 3,11±0,03 4,4 13 3,06±0,07 7,9 6 2,98±0,06 4, принадлежности коров на показатели их молочной продуктивности по результатам первых трех лактаций, выявил достоверные отличия по 1-й лактации по показателям удоя (р 0,01), содержания жира в молоке (р 0,001), количества молочного жира (р 0,01) и содержания молочного белка (р 0,01), а также по 3-й лактации - по показателю содержания молочного белка (р 0,01).

Кластерный анализ генетических расстояний между линиями показал выраженную генетическую дифференциацию отдельных генеалогических линий в отношении уровня показателей молочной продуктивности (рис. 2).

Примечание: Значения бут-стреп вероятностей формирования «ветвей» указаны Рис. 2. Генетические взаимоотношения между линиями коров на основе показателей молочной продуктивности по первой-третьей лактациям Как показано на рисунке 2, на дендограмме формируется два кластера с бут-стреп вероятностью 100%: первый включает МЧ, РС, УИ, ВБА и СТР, второй – линии Ф, РШГ и ФГ. Наибольшей близостью внутри первого кластера характеризуются коровы линий МЧ, РС и УИ, внутри второго кластера – коровы линий Ф и РШГ. Бут-стреп вероятности формирования ветвей внутри кластеров являются относительно низкими.

3.2. Распределение частот встречаемости генотипов и аллелей ДНК-маркеров GH, DGAT1 И TG5 у коров черно-пестрой породы Результаты анализа распределения генотипов и аллелей изучаемых ДНК-маркеров в выборке коров представлены в таблице 4.

Распределение генотипов и аллелей ДНК-маркеров GH, DGAT1 и TG5 у

LL LV VV L V

AA AK KK A K

DGAT

CC CT TT C T

Как показано в таблице 4, наибольшие частоты встречаемости отмечались для аллеля L (78,2%) и гомозиготного генотипа LL (60,4%) в гене GH, для аллеля K (62,0%) и гетерозиготного генотипа AK (60,3%) - в гене DGAT1 и для аллеля С (69,3%) и гетерозиготного генотипа CT (61,4%) – в гене TG5. Анализ генного равновесия по Харди-Вайнбергу показал смещение генного равновесия по всем исследованным ДНК-маркерам (р0,001).

3.3. Генетическая структура различных генеалогических линий 3.3.1. Аллельные профили коров различных генеалогических Результаты анализа распределения аллелей ДНК-маркеров GH, DGAT и TG5 у коров 8-и генеалогических линий, а также оценки их эффективного числа показаны в таблице 5.

Частота встречаемости аллелей в отношении трех генов у коров различных Локус

МЧ Ф РШГ РС УИ ФГ ВБА СТР

DGAT Как показано в таблице 5, наивысшими значениями частоты встречаемости аллеля L гена GH характеризовались коровы линий РШГ (0,900), УИ (0,893) и ВБА (0,875), минимальное значение было отмечено у коров линии Ф (0,763). В отношении гена DGAT1 наибольшее значение частоты встречаемости аллеля K выявлено в линии УИ (0,714), наименьшее – в линии Ф (0,581). В отношении гена TG5, среди коров исследуемого стада преобладали носители аллеля C, частота которого в различных линиях варьировала от 0,600 у коров линии РШГ до 0,740 у коров линии СТР.

Результаты анализа числа эффективных аллелей (Ne) в отношении трех изучаемых генов показаны на рисунке 3.

Рис. 3. Эффективное число аллелей (Ne) в отношении трех генов для коров Наибольшим числом эффективно действующих в популяции аллелей (Ne) в отношении гена GH характеризовались коровы линии СТР (1,61), а наименьшим – коровы линии РШГ (1,22). У коров линии Ф было отмечено максимальное число эффективных аллелей (1,95) по гену DGAT1. Близкие значения также выявлены в линиях РШГ (1,92) и ВБА (1,89). Самый низкий уровень полиморфности наблюдался у коров линии УИ (1,64). По гену TG наибольшим уровнем полиморфности характеризовались коровы линий РШГ (1,92) и МЧ (1,81), при этом линия СТР имела наименьшее значение данного показателя (1,63).

3.3.2. Анализ уровня гетерозиготности популяции Значение уровня гетерозиготности зависит от того, какая система маркеров используется для расчета данного показателя. Поэтому прямое сравнение данного показателя следует проводить только внутри одной маркерной системы при использовании одинакового набора локусов. Вместе с тем следует отметить, что ранжирование групп животных по показателю уровня гетерозиготности имеет одинаковую тенденцию вне зависимости от используемой системы генетических маркеров. В таблице 6 приведены показатели генетического разнообразия в отношении изучаемых локусов для коров различной линейной принадлежности.

Показатели генетического разнообразия в отношении трех локусов для Локус Fis -0,049 -0,131 -0,111 0,105 -0,120 0,043 -0,143 -0, DGAT1 He 0,471 0,487 0,480 0,470 0,408 0,430 0,469 0, Fis -0,245 -0,104 -0,667 -0,419 -0,400 -0,455 -0,600 -0, Fis -0,508 -0,442 -0,667 -0,380 -0,474 -0,500 -0,600 -0, Примечание: Ho – наблюдаемая гетерозиготность; He – ожидаемая Как показано в таблице 6, значение коэффициента инбридинга у индивидуумов по отношению к субпопуляции (Fis) имеет отрицательное значение практически во всех линиях исследованного стада, что указывает на смещение генетического равновесия в сторону избытка гетерозигот в данных группах.

Исключение составили линии РС и ФГ, где было отмечено положительное значение коэффициент Fis по гену GH, что свидетельствует о недостатке гетерозигот в данных линиях.

3.3.3. Характеристика генетических связей между линиями коров На основании частот встречаемости аллелей изучаемых локусов нами были рассчитаны показатели стандартной генетической дистанции Нея М.

(1983) между отдельными линиями коров. Результаты проведенного анализа в графическом выражении представлены на рисунке 4.

Как показано на рисунке 4, структура дендограммы имеет два кластера с бут-стреп вероятностью формирования 100%: первый кластер образован линиями МЧ, Ф, РС и СТР, а второй – линиями РШГ, ВБА, УИ и ФГ.

Наибольшей близостью в отношении частот встречаемости изучаемых ДНКмаркеров характеризуются линии РС и СТР с бут-стреп вероятностью формирования ветви 70%.

Примечание: значения бут-стреп вероятностей формирования «ветвей» указаны Рис. 4. Дендрограмма генетической близости коров Результаты анализа показателей F-статистики для каждого из локусов, а также средние значения для трех локусов показаны в таблице 7.

Показатели F-статистики и числа мигрантов (Nm) на основе частот трех Показатель Как следует из данных таблицы 7, были установлены высокие отрицательные значения показателей Fis и Fit, что указывает на значимый избыток гетерозигот. Низкие значения индекса фиксации (Fst) и, наоборот, высокие – числа мигрантов (Nm) свидетельствуют о слабой генетической дифференциации между линиями в отдельности.

Для более детального исследования генетической структуры анализируемого стада по изучаемым ДНК-маркерам нами был использован мультилокусный подход. Результаты анализа генетической близости изучаемых генеалогических линий на основании частот встречаемости мультилокусных генотипов показаны на рисунке 5. Мультилокусный подход привел к существенным изменениям структуры дерева по сравнению с однолокусным подходом (рис. 4). Семь линий коров за исключением линии ВБА формируют общий кластер с бут-стреп вероятностью 100%.

Примечание: значения бут-стреп вероятностей формирования «ветвей» указаны Рис. 5. Дендрограмма генетической близости коров различных линий, построенная на основе частот встречаемости мультилокусных генотипов Внутри кластера с бут-стреп вероятностью 66% выделяется две ветви.

Одна из которых, образована коровами линий МЧ, Ф, РС, ФГ и СТР, а вторая – коровами линий РШГ и УИ. Принимая во внимание более высокие значения бут-стреп вероятностей формирования отдельных ветвей, можно заключить, что мультилокусный подход к анализу генетической структуры стада приводит к более четкой линейной дифференциации по сравнению с подходом, основанным на рассмотрении каждого из изучаемых локусов в отдельности.

3.4 Изучение влияния генотипов коров по ДНК-маркерам 3.4.1. Молочная продуктивность коров с различными генотипами Анализ показателей молочной продуктивности коров в группах с различными генотипами по GH показан в таблице 8.

Показатели изменчивости признаков молочной продуктивности коров в отношении различных генотипов по локусу GH Показатели

LL LV VV

Показатели

LL LV VV

Примечание: * р 0,05.

Из данных таблицы видно, что коровы с генотипом VV за 3-ю лактацию достоверно превосходили своих сверстниц с генотипом LL по уровню удоя на 1047,1 кг и количеству молочного белка - на 29,7 кг.

3.4.2. Молочная продуктивность коров с различными генотипами Анализ молочной продуктивности в группах коров с различными генотипами по DGAT1 показал, что достоверного влияния генотипа на показатели молочной продуктивности коров выявлено не было.

В качестве тенденции следует отметить превосходство коров с генотипом АА над сверстницами с генотипами АК и КК по уровню удоя по 1-3-й лактациям, при этом, по итогам 3-й лактации, различия носили наиболее выраженный характер (табл. 9).

Показатели изменчивости признаков молочной продуктивности коров в отношении различных генотипов по локусу DGAT Показатели

AA AK KK

Молочный белок, кг 224,7 ± 12,4 218,6 ± 4,5 216,3 ± 5, Показатели

AA AK KK

3.4.3. Молочная продуктивность коров с различными генотипами Результаты анализа молочной продуктивности коров с различными генотипами по локусу TG5 представлены в таблице 10.

Как следует из данных таблицы 10, коровы с генотипом СТ достоверно превосходили сверстниц с генотипом СС по количеству молочного жира по итогам 2-й лактации на 15,6 кг (p0,05).

Показатели изменчивости признаков молочной продуктивности исследуемых коров в отношении различных генотипов по локусу TG Примечание: * р 0,05.

3.4.4. Влияние мультилокусных генотипов по GH, DGAT1 и TG5 на показатели молочной продуктивности коров различных В связи с тем, что мультилокусный подход к анализу генетической структурированности животных изученного стада выявил более четкую линейную дифференциацию, то нами были рассмотрены возможные связи между распределением мультилокусных генотипов по изучаемым ДНКмаркерам в генеалогических линиях, с показателями молочной продуктивности. Проведенный анализ показал наличие достоверной связи некоторых мультилокусных генотипов с показателями молочной продуктивности коров различных генеалогических линий (рис. 6).

Рис. 6. Показатели продуктивности и частоты встречаемости отдельных мультилокусных генотипов по GH, DGAT1 и TG5 у первотелок Так, наблюдалась достоверная корреляция (p0,05) между частотой встречаемости генотипа LL/AK/CC и уровнем удоя за 305 дней 1-ой лактации (рис. 6 А), а так же достоверная корреляция (p0,01) между частотой встречаемости генотипа LV/AK/CC и содержанием жира в молоке по 1-й лактации (рис. 6 Б).

1. Выявлены достоверные различия по показателям молочной продуктивности коров различных генеалогических линий по результатам 3-й лактации: по уровню удоя (F = 2,78; p = 0,0083), содержанию жира в молоке (F = 5,74; p = 0,0000), количеству молочного жира (F = 3,48; p = 0,0014), содержанию белка в молоке (F = 3,53; p = 0,0022) и количеству молочного белка (F = 3,08; p = 0,0064).

2. Исследование полиморфизма ДНК-маркеров гормона роста (GH), диацилглицерол О-ацилтрансферазы 1 (DGAT1) и тиреоглобулина (TG5) у коров черно-пестрой породы показало наличие аллелей L и V, А и К, С и Т, соответственно. Максимальные частоты встречаемости отмечены для генотипа LL по GH (60,4%), генотипа АК по DGAT1 (60,3%) и генотипа CT по TG5 (61,4%).

3. Анализ распределения генотипов и аллелей ДНК-маркеров GH, DGAT1 и TG5 показал отсутствие достоверных различий между генеалогическими линиями коров. Частота встречаемости аллеля L гена GH варьировала от 0,763 в линии Франса до 0,900 в линии Рамандейл Шаммар Гениуса; аллеля К гена DGAT1 - от 0,581 в линии Франса до 0,714 в линии Уес Идеала; аллеля С гена TG5 - от 0,725 в линии Рефлекшен Соверинга до 0,740 в линии Силинг Трайджун Рокита. За исключением линий Рефлекшн Соверинга и Файнтелекс Грейлита по локусу GH, во всех генеалогических линиях установлен избыток гетерозигот по трем изучаемым ДНК-маркерам.

4. Установлена более четкая линейная дифференциация стада при использовании подхода, основанного на мультилокусных генотипах, по сравнению с анализом по отдельными локусам ДНК-маркеров GH, DGAT1 и TG5. Линии Монтвик-Чифтейна, Франса, Рефлекшен Соверинг, Файнтелекс Грейлита, Силинг Трайджут Рокита, Рамандейл Шаммар Гениуса и Уес Идеала с бут-стреп вероятностью 100% образуют общий кластер. Внутри кластера с бут-стреп вероятностью 66% выделяется две ветви, одна из которых образована коровами линий Монтвик-Чифтейна, Франса, Рефлекшен Соверинг, Файнтелекс Грейлита и Силинг Трайджут Рокита, а вторая – коровами линий Рамандейл Шаммар Гениуса и Уес Идеала.

5. Анализ показателей F-статистики для каждого локуса, а также средние оценки для трех локусов показали высокие отрицательные значения показателей Fis и Fit (-0,327 и -0,311 в среднем для трех локусов, соответственно), что свидетельствует о значимом избытке гетерозигот в популяции. Низкие значения Fst (0,012) и, наоборот, высокие – для Nm (19,8) указывают на слабую генетическую дифференциацию между генеалогическими линиями по отношению к изучаемым ДНК-маркерам.

6. Установлены различия по некоторым показателям молочной продуктивности между группами коров с различными генотипами по изучаемым ДНК-маркерам. Коровы с генотипом VV по GH достоверно превосходили своих сверстниц по уровню удоя на 1047,1 кг (p0,05) и количеству молочного белка за 3-ю лактацию на 29,7 кг (p0,05). Коровы с генотипом СТ по TG5 достоверно превосходили сверстниц с генотипом СС по количеству молочного жира по итогам 2-й лактации на 14,6 кг (p0,05).

Показана тенденция превосходства коров с генотипом АА по DGAT1 по уровню удоя на 229,9, 384,8 и 840,1 кг по результатам 1-, 2- и 3-й лактаций, соответственно.

7. Установлены достоверные зависимости между распределением мультилокусных генотипов и уровнем молочной продуктивности первотелок различных генеалогических линий: генотипа LL/AK/CC и уровня удоя за дней лактации (p0,05), генотипа LV/AK/CC и содержания жира в молоке (p0,01).

5. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

Лабораториям молекулярно-генетической экспертизы для накопления в стадах желательных комплексных генотипов рекомендуем проводить генетическое тестирование коров черно-пестрой породы по генам гормона роста (GH), диацилглицерол О-ацилтрансферазы 1 (DGAT1) и тиреоглобулина (TG5).

Список опубликованных работ В журналах, рекомендованных ВАК.

1. Харзинова, В.Р. Полиморфизм ДНК-маркеров DGAT1, TG5 и GH в связи с линейной принадлежностью и уровнем молочной продуктивности коров черно-пестрой породы / Харзинова В.Р., Зиновьева Н.А., Гладырь Е.А // Проблемы биологии продуктивных животных. 2011 - № 1. С. 73-77.

2. Зиновьева, Н.А. Роль ДНК – маркеров признаков продуктивности сельскохозяйственных животных / Зиновьева Н.А., Костюнина О.В., Гладырь Е.А., Банникова А.Д., Харзинова В.Р., Ларионова П.В., Шавырина К.М., Эрнст Л.К. // Зоотехния. 2010 - №1. С. 8-10.

В других изданиях.

3. Харзинова, В.Р. Полиморфизм гена BGH у коров черно-пестрой породы / Харзинова В.Р., Зиновьева Н.А., Гусев И.В. // Сборник трудов международной научно-практической конференции «Проблемы увеличения производства продуктов животноводства и пути их решения», Дубровицы, 21-28 октября 2008. - С. 442-443.

4. Харзинова, В.Р. Изучение полиморфизма гена DGAT1 у коров черно-пестрой породы и его связи с признаками молочной продуктивности / Харзинова В.Р., Зиновьева Н.А. // Сборник материалов научной конференции «Достижения в генетике, селекции и воспроизводстве сельскохозяйственных животных», 9-11 июня 2010. - С. 19-22.

5. Харзинова, В.Р. Генетическая структура коров различных генеалогических линий / Харзинова В.Р., Зиновьева Н.А. // В сборнике Международной конференции «ЕС – Россия: 7-я Рамочная программа в области биотехнологии, сельского, лесного, рыбного хозяйства и пищи», г.

Уфа, БашГАУ, 29 сент. - 5 окт. 2010. – С. 142-144.

6. Харзинова, В.Р. Технология раннего отбора животных по жирномолочности посредством современной ДНК-диагностики / Харзинова В.Р.// Сборник трудов 7-ой Международной научной конференции-школы:

сельскохозяйственных животных: роль нанотехнологий в реализации приоритетных задач биотехнологии», БиоТехЖ, Дубровицы, 2008. – С. 282- 284.



 
Похожие работы:

«КОЗЛОВА Юлия Алексеевна ДИНАМИКА ЧИСЛЕННОСТИ КРОВОСОСУЩИХ ЧЛЕНИСТОНОГИХ И СОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ ПРОФИЛАКТИЧЕСКИХ МЕРОПРИЯТИЙ В АНТРОПОБИОЦЕНОЗАХ ПРЕДБАЙКАЛЬЯ 03.00.16 – экология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Улан-Удэ – 2009 2 Работа выполнена в ГОУ ВПО Иркутский государственный университет Федерального агентства по образованию (г. Иркутск) и ФГУЗ Иркутский ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный...»

«Ашихмин Александр Александрович Каротиноиды светособирающих комплексов пурпурной серной бактерии Ectothiorhodospira haloalkaliphila 03.01.04 – биохимия АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание учёной степени кандидата биологических наук Пущино – 2014 2 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Институте фундаментальных проблем биологии Российской академии наук (ИФПБ РАН) Научный руководитель : доктор биологических наук Москаленко Андрей Анатольевич...»

«ТИТОВА СВЕТЛАНА АНАТОЛЬЕВНА Влияние фитопатогенных микроорганизмов на энзиматическую активность растения-хозяина Glycine max (L.) Merr. и Glycine soja Sieb. et Zucc. 03.02.08 – экология (биология) Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Благовещенск – 2014 Работа выполнена в научно-исследовательской лаборатории Соя ФГБОУ ВПО Дальневосточный государственный аграрный университет Научный руководитель кандидат биологических наук, доцент...»

«САРАНЦЕВА Светлана Владимировна РОЛЬ ГЕНОВ ПРЕСЕНИЛИНА 1 И БЕЛКА ПРЕДШЕСТВЕННИКА АМИЛОИДА В ДИСФУНКЦИИ СИНАПСОВ ПРИ БОЛЕЗНИ АЛЬЦГЕЙМЕРА 03.02.07 – генетика АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук Санкт-Петербург 2012 2 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова Научный консультант : доктор биологических наук Шварцман Александр Львович, Федеральное...»

«Левицкая Наталья Николаевна Критерии и индикаторы для оценки состояния лесов Московской области Специальность 03.02.08 – Экология Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Москва – 2012 Диссертационная работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Центр по проблемам экологии и продуктивности лесов РАН Научный руководитель : Черненькова Татьяна Владимировна, доктор биологических наук, ведущий научный сотрудник...»

«ТИМОФЕЕВ Эдуард Николаевич ИММОБИЛИЗОВАННЫЕ И МОДИФИЦИРОВАННЫЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ В ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ ДУПЛЕКСОВ И ТРИПЛЕКСОВ ДНК 03.00.03 – Молекулярная биология Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора химических наук Москва 2009 Работа выполнена в Лаборатории стереохимии ферментативных реакций Учреждения Российской Академии Наук Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН Официальные оппоненты : Доктор физико-математических наук,...»

«КОЗЛОВА Людмила Валерьевна Глюкан со смешанным типом связей и глюкуроноарабиноксилан в ходе роста корней и колеоптилей кукурузы (Zea mays L.) 03.01.05 – физиология и биохимия растений АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук КАЗАНЬ 2012 2 Работа выполнена в лаборатории механизмов роста растительных клеток Федерального государственного бюджетного учреждения науки Казанского института биохимии и биофизики Казанского научного центра...»

«ШЕВЦОВ Александр Станиславович АНТРОПОГЕННАЯ ЭЛИМИНАЦИЯ НАЗЕМНЫХ ПОЗВОНОЧНЫХ ЦЕНТРАЛЬНОГО ПРЕДКАВКАЗЬЯ 03.02.08 – экология (биологические наук и) Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Ростов-на-Дону – 2013 2 Работа выполнена на кафедре ботаники, зоологии и общей биологии ФГАОУ ВПО Северо-Кавказский федеральный университет Научный руководитель : доктор биологических наук, доцент Ильюх Михаил Павлович Официальные оппоненты : Бабенко...»

«Новожилова Наталья Михайловна Метаболизм D-арабинозы: характеристика бифункциональной арабинокиназы/пирофосфорилазы Leishmania major. 03.01.04 – Биохимия Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата химических наук Москва 2010 1   Работа выполнена в лаборатории углеводов Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и...»

«САЛИНА Елена Геннадьевна НЕКУЛЬТИВИРУЕМЫЕ ФОРМЫ БАКТЕРИЙ MYCOBACTERIUM SMEGMATIS И MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS И ИХ БИОХИМИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА Специальность 03.00.04 – биохимия АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Москва 2006 Работа выполнена в Лаборатории биохимии стрессов микроорганизмов Института биохимии им. А.Н. Баха РАН Научный руководитель доктор биологических наук, профессор Капрельянц Арсений Сумбатович Официальные...»

«ЛАВРЕНЧЕНКО Леонид Александрович МЛЕКОПИТАЮЩИЕ ЭФИОПСКОГО НАГОРЬЯ: ПУТИ И ОСОБЕННОСТИ ФОРМИРОВАНИЯ ФАУНЫ ГОРНЫХ ТРОПИКОВ 03.00.08 – зоология Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора биологических наук Москва 2009 Работа выполнена в Учреждении Российской академии наук Институте проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН доктор биологических наук, профессор, Официальные оппоненты : Никольский Александр Александрович доктор биологических наук, Холодова...»

«ОВАНЕСОВ Михаил Владимирович Влияние факторов внутреннего пути свертывания крови на пространственную динамику роста сгустка 03.00.02 - биофизика АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Москва 2002 2 Работа выполнена в Государственном учреждении Гематологический Научный Центр Российской Академии Медицинских Наук. Научный руководитель - доктор биологических наук, профессор Ф.И. Атауллаханов Официальные оппоненты - доктор медицинских...»

«Шлеева Маргарита Олеговна ПОКОЯЩИЕСЯ ФОРМЫ БАКТЕРИЙ РОДА MYCOBACTERIUM: ПОЛУЧЕНИЕ, БИОХИМИЧЕСКИЕ ФАКТОРЫ РЕАКТИВАЦИИ. Специальность 03.00.04 – биохимия АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Москва-2004 1 Работа выполнена в лаборатории биохимии стрессов микроорганизмов Института биохимии им. А.Н. Баха РАН Научный руководитель : доктор биологических наук, профессор Капрельянц Арсений Сумбатович Официальные оппоненты : доктор...»

«Макеев Всеволод Юрьевич Определение регуляторных сегментов в геномах методами теоретического анализа последовательностей нуклеотидов ДНК 03.00.02 Биофизика АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени доктора физико-математических наук Москва – 2009 1 Работа выполнена в лаборатории биоинформатики ФГУП Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов ГосНИИгенетика. Научный консультант : Доктор физико-математических...»

«ДУХОВЛИНОВА Елена Николаевна ИЗУЧЕНИЕ РАЗНООБРАЗИЯ ГЕНА env ШТАММОВ ВИЧ-1, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В ГРУППАХ РИСКА В САНКТПЕТЕРБУРГЕ 03.01.04 – Биохимия 03.01.03 – Молекулярная биология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Санкт-Петербург 2010 Работа выполнена в лаборатории негосударственного научноисследовательского учреждения Биомедицинский центр, Санкт-Петербург. Научный руководитель - доктор...»

«Пудова Туяра Максимовна ВЛИЯНИЕ АНТРОПОГЕННЫХ ФАКТОРОВ НА МУТАГЕННУЮ АКТИВНОСТЬ ПОЧВ НА ПРИМЕРЕ ЦЕНТРАЛЬНОЙ И ЗАПАДНОЙ ЯКУТИИ 03.02.08. – Экология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Якутск – 2011 Работа выполнена в лаборатории прикладной зоологии и биоиндикации Научно-исследовательского института прикладной экологии Севера ФГАОУ ВПО Северо-Восточного Федерального Университета им. М.К. Аммосова Научный руководитель : доктор...»

«ПАВЛУШИН Сергей Викторович ВЛИЯНИЕ ФЕНОЛОГИЧЕСКОГО ВОЗРАСТА ЛИСТЬЕВ БЕРЕЗЫ ПОВИСЛОЙ (Betula pendula Roth.) НА НЕПАРНОГО ШЕЛКОПРЯДА (Lymantria dispar L.) И ТЕЧЕНИЕ ВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ 03.02.05 – энтомология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Новосибирск – 2013 Работа выполнена в лаборатории патологии насекомых Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института систематики и экологии животных СО РАН Научный...»

«ДИДАНОВА ЕЛЕНА НАЖМУДИНОВНА ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА И КАДАСТРОВАЯ ОЦЕНКА ПОЧВ ЛЕСОСТЕПНОЙ ЗОНЫ КАБАРДИНО-БАЛКАРСКОЙ РЕСПУБЛИКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ 03.00.27 – почвоведение АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Ростов-на-Дону 2008 2 Работа выполнена на кафедре почвоведения, агрохимии и физиологии растений Кабардино-Балкарской государственной сельскохозяйственной академии имени В.М. Кокова Научный руководитель : доктор...»

«Кондратов Евгений Владимирович ЭКОЛОГИЧЕСКОЕ СОСТОЯНИЕ СОСНОВЫХ ДРЕВОСТОЕВ В УСЛОВИЯХ АЭРОТЕХНОГЕННОГО ЗАГРЯЗНЕНИЯ 03.00.16 – Экология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата сельскохозяйственных наук Братск 2009 Работа выполнена на кафедре Лесоинженерного дела ГОУ ВПО Братский государственный университет (г. Братск) Научный руководитель – доктор технических наук, профессор Угрюмов Борис Иванович Официальные оппоненты – доктор биологических наук,...»

«ДОМАНИЦКАЯ НАТАЛЬЯ ВАСИЛЬЕВНА РОЛЬ ABCC10-ТРАНСПОРТЕРА В ФОРМИРОВАНИИ МНОЖЕСТВЕННОЙ ЛЕКАРСТВЕННОЙ УСТОЙЧИВОСТИ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ ПРИ ЛЕЧЕНИИ ТАКСАНАМИ 03.01.04 – биохимия Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Новосибирск – 2014 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении Научноисследовательский институт молекулярной биологии и биофизики Сибирского отделения Российской академии медицинских наук, г....»






 
© 2013 www.diss.seluk.ru - «Бесплатная электронная библиотека - Авторефераты, Диссертации, Монографии, Методички, учебные программы»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.